При активации Акта выполненных работ указанные в нем товары списываются автоматически.

Товары включенные в акт выполненных работ указываются в документе Акт выполненных работ в разделе “товары и услуги”

Укажите в документе склад с которого будут списаны товары и укажите товары которые были использованы.

Использованные товары подлежащие списанию со склада могут быть входящими в стоимость услуги или нет. Нужно указать все товары которые были использованы, для корректного движения по складам и отчетов.