Учет в программе Вет-Ассистент ведется в разрезе организаций и филиалов. Организацией является юридическое лицо или индивидуальный предприниматель. Филиал является подразделением организации.

Объекты учета в программе могут быть связаны с филиалом или с организацией. Например, учет зарплаты ведется в контексте организации, а документы, создаваемые в программе привязаны к филиалу.

Количество организаций и филиалов по которым ведется учет в программе не ограничен.